研究稱蛋白質(zhì)Nsp13也許是新冠藥物研發(fā)新靶點
2022-01-14 10:46:22 來源:科技日報
科技日報北京1月13日電 (實習記者張佳欣)新冠肺炎的許多治療方法都將目標集中在病毒用于與人類細胞結(jié)合的刺突蛋白上。雖然這些療法對原始新冠病毒效果很好,但對未來的新變種可能沒有那么有效。根據(jù)近日發(fā)表在《科學進展》雜志上的論文,美國芝加哥大學普利茲克分子工程學院教授胡安·德·巴勃羅的團隊利用先進的計算模擬技術(shù)研究了另一種對病毒復制至關(guān)重要的蛋白質(zhì)——Nsp13,它在不同的冠狀病毒中保持相對一致,屬于一類被稱為解旋酶的酶,這種酶在病毒的復制過程中發(fā)揮作用。
通過這項工作,科學家們還發(fā)現(xiàn)了三種不同的化合物,它們可以與Nsp13結(jié)合并抑制病毒復制。鑒于各種冠狀病毒變異株的解旋酶序列的一致性,這些抑制劑可以作為設(shè)計靶向解旋酶的新冠肺炎治療藥物的開端。
德·巴勃羅說:“我們目前只有一種治療新冠肺炎的方法,隨著病毒的變異,我們絕對需要針對刺突蛋白之外的不同病毒構(gòu)建塊。我們的工作揭示了小分子如何能夠在病毒復制中調(diào)節(jié)一個有吸引力的目標的行為,并表明現(xiàn)有的分子支架是治療新冠肺炎的有希望的候選藥物?!?/p>
研究人員發(fā)現(xiàn),蛋白質(zhì)Nsp13可以將雙鏈DNA解離成兩條單鏈,這是病毒復制過程中的關(guān)鍵一步。他們還發(fā)現(xiàn),當外部分子與蛋白質(zhì)的某些位點結(jié)合時,就會擾亂Nsp13中多個結(jié)構(gòu)域的通信網(wǎng)絡(luò)。這意味著Nsp13無法再有效地解開DNA,病毒的復制將變得更加困難。
據(jù)報道,有幾種化合物可作為Nsp13抑制劑,此次,研究人員選擇了三種化合物進行模擬測試:巴那寧、SSYA10-001和色原酮-4c。他們發(fā)現(xiàn),這三種化合物似乎都能有效破壞Nsp13,因為它們與特定的位點結(jié)合,破壞了蛋白質(zhì)的網(wǎng)絡(luò)?,F(xiàn)在,德·巴勃羅和他的合作者還將在實驗室里測試他們的結(jié)果。
此前,該小組使用計算機分析來揭示藥物依布硒啉是如何與病毒的主要蛋白酶(Mpro)結(jié)合的。在另一項研究中,他們還揭示了抗病毒藥物瑞德西韋是如何與病毒結(jié)合并干擾病毒的。他們還展示了復合木犀草素是如何抑制病毒的復制能力的。
研究人員稱,他們利用模擬信息設(shè)計了一種治療新冠肺炎的新藥,希望在接下來的幾個月內(nèi)發(fā)表。
德·巴勃羅說:“我們新設(shè)計的藥物可能會改變未來治療新冠肺炎的‘游戲規(guī)則’?!?/p>
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